Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
POLR2J2Q9GZM3 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms