Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIN3AQ96ST3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIN3AQ96ST3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms