Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms