Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHAMP1Q96JM3 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms