Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RNF182Q8N6D2 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms