Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF827Q17R98 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms