Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTCH1Q13635 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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