Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CYP27C1-202ENST00000409327 2092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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FOXD4Q12950 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXD4Q12950 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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