Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP46P62068 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP46P62068 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP46P62068 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP46P62068 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP46P62068 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
USP46P62068 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
USP46P62068 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
USP46P62068 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms