Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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