Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms