Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms