Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
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