Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CYP39A1-205ENST00000619708 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 C3orf52-204ENST00000480282 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC097487.1-201ENST00000514134 934 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC005154.1-216ENST00000582145 1101 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 BOLA2P2-202ENST00000604904 567 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AL354707.1-201ENST00000615168 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CAMK2BQ13554 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms