Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP46P62068 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP46P62068 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP46P62068 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP46P62068 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP46P62068 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP46P62068 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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USP46P62068 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USP46P62068 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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USP46P62068 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USP46P62068 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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