Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms