Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 LINC02381-202ENST00000635070 1341 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SNAPC5-207ENST00000566658 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMARCA4P51532 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms