Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP8P40818 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
USP8P40818 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
USP8P40818 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms