Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT3P35638 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms