Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFNP31947 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFNP31947 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFNP31947 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms