Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CASP1P29466 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms