Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
EFNA1P20827 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
EFNA1P20827 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms