Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM21P19474 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms