Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYP2C9P11712 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms