Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BP0C0L5 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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