Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms