Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ODF3BA8MYP8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms