Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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