Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms