Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNIH4Q9P003 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms