Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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CEP44Q9C0F1 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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CEP44Q9C0F1 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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CEP44Q9C0F1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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CEP44Q9C0F1 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CEP44Q9C0F1 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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