Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PLVAPQ9BX97 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms