Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms