Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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