Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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RTL8BQ17RB0 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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RTL8BQ17RB0 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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RTL8BQ17RB0 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
RTL8BQ17RB0 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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