Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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