Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP46P62068 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP46P62068 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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USP46P62068 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USP46P62068 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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