Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNA2P51530 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNA2P51530 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNA2P51530 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNA2P51530 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DNA2P51530 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms