Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms