Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP1P29466 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms