Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYT1P21579 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYT1P21579 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms