Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LTAP01374 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LTAP01374 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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LTAP01374 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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LTAP01374 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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LTAP01374 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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LTAP01374 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LTAP01374 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LTAP01374 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LTAP01374 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LTAP01374 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LTAP01374 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LTAP01374 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LTAP01374 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LTAP01374 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LTAP01374 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LTAP01374 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LTAP01374 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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