Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHBDL3-201ENST00000269051 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL1R2-201ENST00000332549 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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