Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms