Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
V9GYQ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
V9GYQ6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
V9GYQ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
V9GYQ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
V9GYQ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
V9GYQ6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
V9GYQ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
V9GYQ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
V9GYQ6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
V9GYQ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
V9GYQ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
V9GYQ6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
V9GYQ6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
V9GYQ6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
V9GYQ6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
V9GYQ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
V9GYQ6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
V9GYQ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
V9GYQ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
V9GYQ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
V9GYQ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
V9GYQ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
V9GYQ6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
V9GYQ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYQ6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYQ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYQ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYQ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYQ6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYQ6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYQ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYQ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYQ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYQ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYQ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYQ6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
V9GYQ6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
V9GYQ6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
V9GYQ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
V9GYQ6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
V9GYQ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
V9GYQ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
V9GYQ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
V9GYQ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
V9GYQ6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
V9GYQ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
V9GYQ6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
V9GYQ6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
V9GYQ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
V9GYQ6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
V9GYQ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
V9GYQ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
V9GYQ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
V9GYQ6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
V9GYQ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
V9GYQ6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
V9GYQ6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
V9GYQ6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
V9GYQ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
V9GYQ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
V9GYQ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
V9GYQ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
V9GYQ6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
V9GYQ6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
V9GYQ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
V9GYQ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
V9GYQ6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
V9GYQ6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
V9GYQ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
V9GYQ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
V9GYQ6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms