Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARFGEF1Q9Y6D6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARFGEF1Q9Y6D6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARFGEF1Q9Y6D6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms