Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC1Q9Y5R8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms