Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAI2Q9Y5P3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAI2Q9Y5P3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAI2Q9Y5P3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAI2Q9Y5P3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAI2Q9Y5P3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAI2Q9Y5P3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAI2Q9Y5P3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAI2Q9Y5P3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms