Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHTOPQ9Y3Y2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHTOPQ9Y3Y2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms