Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W6

TDRKH, Tudor and KH domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRKHQ9Y2W6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TDRKHQ9Y2W6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TDRKHQ9Y2W6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms